Медицинские учреждения могут воспользоваться нулевой ставкой по налогу на прибыль при соблюдении определенных требований. Несоблюдение условия, касающегося соотношения доходов по итогам отчетных периодов – первого квартала, полугодия и девяти месяцев, не лишает их этого права. Важно лишь, чтобы условие было выполнено по результатам года.

Условия для нулевой ставки

Какие критерии необходимо выполнить медицинским организациям, чтобы воспользоваться нулевой ставкой по налогу на прибыль установлены статьей 284.1 Налогового кодекса:

• у фирмы должна быть соответствующая лицензия. Перечень лицензируемых видов деятельности установлен постановлением Правительства РФ от 1 июня 2021 г. № 852;
• доходы от медицинской деятельности должны составлять не менее 90 процентов всех доходов либо доходов, облагаемых налогом на прибыль, нет вообще;
• штат компании должен насчитывать не менее 15 работников. Работники, принятые по совместительству из других организаций, в списочную численность не включаются (письмо Минфина от 21 октября 2019 г. № 03-03-06/1/80568);
• в налоговом периоде, в котором применяется нулевая ставка, не должно быть операций с векселями и финансовыми инструментами срочных сделок;
• вид деятельности должен входить в Перечень видов медицинской деятельности, он регламентируется Постановлением Правительства РФ № 917, принятым 10 ноября 2011 года.

Медицинские учреждения должны обеспечивать, чтобы не менее половины их сотрудников имели сертификат специалиста.

Согласно разъяснениям, представленным в письме ФНС от 11 ноября 2022 г. № СД-19-3/257, мобилизованные работники медицинской организации должны учитываться в общем количестве сотрудников для сохранения права на применение нулевой ставки по налогу на прибыль).

В случае несоблюдения хотя бы одного из перечисленных требований, налог на прибыль с начала текущего года подлежит уплате по ставке 20 процентов (согласно письму Минфина от 13 мая 2024 г. № 03-03-06/1/43267).

Несоблюдение установленного соотношения доходов по результатам отчетных периодов – за первый квартал, за полугодие и за девять месяцев – не лишает организации возможности применять нулевую ставку по налогу на прибыль. Значимость имеет только итоговый результат за год (согласно письму Межрайонного управления Федеральной налоговой службы № 16-15/053964@ от 20 июня 2012 г@).

Чтобы избежать внезапной утраты права, необходимо постоянно следить за уровнем доходов на протяжении всего года.

Как считать доходы

При расчете долевого соотношения доходов, дающего компании право на применение нулевой ставки по налогу на прибыль, необходимо принимать во внимание только доходы, полученные от деятельности, которая входит Перечень. Расчет производится с учетом вычтенной суммы НДС, которую налогоплательщик предъявил покупателю (см. письма Минфина России от 1 ноября 2012 г. № 03-03-06/4/105, от 14 декабря 2011 г. № 03-03-06/4/145).

Согласно письму Минфина России от 23 мая 2012 г. № 03-03-06/4/46, округление доли доходов не допускается. Доходы, полученные от оказания медицинских услуг, должны составлять не менее 90 процентов от общего объема доходов или доходов, подлежащих налогообложению по налогу на прибыль. В случае, если доля таких доходов составит 89,9%, льгота не может быть применена, поскольку это ниже установленного порога в 90%).

Не допускается объединение доходов, полученных на льготных условиях, для достижения необходимого процента. К примеру, организация осуществляет медицинскую деятельность. Помимо этого, она предоставляет социальные услуги населению (право на налоговую льготу для организаций, оказывающих социальные услуги, установлено статьей 284.5 Налогового кодекса). Даже если общая выручка от этих двух видов деятельности составит 90% от общей суммы налогооблагаемых доходов, но по каждому из них в отдельности будет составлять менее 90%, то налог на прибыль компания должна уплачивать по стандартным ставкам (письмо Минфина России от 17 июля 2015 г. № 03-03-10/41223).

Медицинская организация имеет право предоставлять платные медицинские услуги самостоятельно или совместно с другим учреждением, при условии, что обе организации обладают необходимой лицензией на осуществление данного вида деятельности.

Доходы медицинской организации, полученные за платные медицинские услуги, такие как забор крови и проведение лабораторных исследований, а также в случаях привлечения другой медицинской организации для проведения таких исследований по договору, рассматриваются как доходы от медицинской деятельности. Соответственно, эти доходы включаются в состав доходов, полученных в процессе осуществления медицинской деятельности, при расчете доли дохода, установленной пунктом 3 статьи 284.1 Налогового кодекса Российской Федерации.

Посреднические услуги, оказываемые соисполнителями, не дают права на применение нулевой ставки по налогу на прибыль организаций, поскольку они не указаны в соответствующем перечне (письмо Минфина от 20 декабря 2023 г. № 03-03-06/1/123463).

Проценты по депозитам и субсидии

Если медицинская организация размещает имеющиеся свободные денежные средства на депозитных счетах в банке, она может применять нулевую ставку по налогу на прибыль к полученным доходам (при соблюдении прочих условий, установленных статьей 284.1 Налогового кодекса РФ для применения льготы) (согласно письму Минфина от 23 июля 2025 г. № 03-03-06/1/71273).

В соответствии с установленной практикой, субсидии, за исключением тех, которые освобождены от налога на прибыль согласно статье 251 Налогового кодекса Российской Федерации, включаются в состав внереализационных доходов:

• по мере осуществления и признания таких расходов;
• или единовременно, если к моменту их получения они были произведены и признаны в налоговом учете.

В письме от 27 июня 2023 г. № 03-03-06/1/59567 Минфин информирует медицинские организации о том, что при расчете доли доходов, полученных от основной деятельности, определенные субсидии не включаются. Сумма субсидии, полученной медорганизацией и не имеющей отношения к оказанию медицинских услуг, не учитывается как доход от профильной деятельности при определении лимита. В противном случае допустимая доля доходов будет искусственно увеличена, что может привести к потере льготных положений.

Доходы от реализации ОС

В письме от 23 июля 2025 года № 03-03-06/1/71445 Минфин дополнительно указывает, что прибыль медицинской организации, полученная от продажи амортизируемого имущества, включая здания, не относится к доходам от медицинской деятельности. В связи с этим, она не может быть включена в расчет доходов, позволяющих применять нулевую ставку по налогу на прибыль.

В этом подтверждается письмом Минфина от 26 сентября 2025 года № 03-03-06/1/93689. Полученный медорганизацией доход от продажи основных средств, в том числе медицинского оборудования, применяемого в основной деятельности, не может быть отнесен к доходу от медицинской деятельности, дающему право на освобождение от налога на прибыль.