В случае отсутствия правильно оформленного первичного документа или выявления ошибок при его корректировке в ходе налогового контроля, предусмотрены штрафные санкции.

Так, статья 120 Налогового кодекса РФ «отсутствие первичных документов, несоответствие данных в первичных документах, таких как счета-фактуры или регистры бухгалтерского и налогового учета, рассматривается как существенное нарушение установленных правил формирования доходов, расходов и объектов налогообложения».

За данное нарушение предусмотрен штраф в размере 10 000 рублей. При повторных нарушениях, допущенных в различные налоговые периоды, сумма штрафа увеличивается до 30 000 рублей.

В случае, когда нарушение привело к уменьшению налогооблагаемой базы, предусмотрен штраф в размере 20% от суммы неуплаченного налога, однако он не может быть меньше 40 000 рублей.

Статья 120 Налогового кодекса применима как к организациям, так и к индивидуальным предпринимателям.

Не менее важным является и следующий риск. В соответствии со статьей 252 Налогового кодекса Российской Федерации, обоснованные и имеющие документальное подтверждение затраты признаются расходами.

В случае предоставления документа, подтверждающего понесенные организацией расходы (например, акт приемки-сдачи выполненных работ), если документы, подтверждающие понесенные расходы, не оформлены должным образом или содержат существенные ошибки, налоговые органы могут не учесть их при расчете налогов.

Вам будет предъявлен иск о взыскании суммы недоплаченного налога, включая пени.

Также инспекция имеет право наложить штраф согласно статье 122 «Неуплата или частичная уплата сумм налога (сбора)» Налогового кодекса. Данная статья предусматривает штраф в размере 20% от неуплаченной суммы налога (сбора), а в случае умышленного действия – в размере 40%.

Следует обратить внимание на важный аспект: налоговая инспекция не имеет права одновременно предъявлять требования об уплате штрафов за одно и то же нарушение по статьям 120 и 122 Налогового кодекса (определение Конституционного Суда РФ от 18 января 2001 г. № б-О).

Если вы занизили налоговую базу и не уплатили налог из-за грубого нарушения правил учета, вас оштрафуют по пункту 3 статьи 120. Если вы занизили налоговую базу и не уплатили налог по другой причине, вас оштрафуют по статье 122.
Если же налоговая инспекция за одно и то же нарушение предъявила вам штрафы одновременно по двум вышеуказанным статьям, не спешите с этим соглашаться.

Вероятность того, что налоговые органы смогут подтвердить свою позицию в арбитражном разбирательстве, представляется низкой.

В то же время, местные налоговые инспекторы часто давали собственные интерпретации и другим положениям налогового законодательства. В частности, если организация оформляла документы в свободной форме для операций, по которым существовали типовые бланки, налоговые органы могли расценивать это как «грубое нарушение правил учета доходов, расходов и объектов налогообложения».

Аналогичный вывод был бы возможен, даже если организация не указала всю необходимую информацию в стандартной форме.

По данным судебной практики арбитражных судов, в аналогичных ситуациях они нередко поддерживают позицию налогоплательщиков.

САНКЦИИ ЗА НЕПРАВИЛЬНОЕ СОСТАВЛЕНИЕ ПЕРВИЧНЫХ ДОКУМЕНТОВ 
Компания осуществила перевод денежных средств иностранному партнеру в качестве оплаты консультационных услуг. 
В акте об оказанных услугах отсутствовали некоторые обязательные сведения. 
В ходе проверки, проведенной сотрудниками налоговой инспекции, данное действие было квалифицировано как несоблюдение положений Федерального закона «О бухгалтерском учете», в результате чего сумма, выплаченная иностранному партнеру, была исключена из себестоимости. 
В результате было принято решение о доначислении налога, а также о взыскании с предприятия пеней и штрафа. 
Компания не согласилась с решением инспекции и подала иск в арбитражный суд. 
Рассмотрев материалы дела, суд поддержал позицию предприятия. В частности, было отмечено, что «несущественные ошибки в оформлении первичной документации... не являются основанием для утверждения об отсутствии хозяйственной операции, равно как и об отсутствии у предприятия расходов, связанных с оплатой консультационных услуг». 

В бухгалтерском учете не допускается отражение документов, подтверждающих несуществующие хозяйственные операции, включая те, которые служат основой для мнимых и притворных сделок, в результате проведенного анализа, должностные лица установили, кто несет ответственность за оформление данных документов в учете.

Лицо, подготовившее первичный документ, считается ответственным за фиксацию хозяйственного события. Этот субъект (будь то физическое или юридическое лицо) обязан обеспечить передачу оформленного документа в бухгалтерию для внесения в учетные записи в установленные сроки и подтвердить точность содержащейся в нем информации.

В отношении лиц, ответственных за бухгалтерский учет (таких как бухгалтер, руководитель организации или привлеченная бухгалтерская фирма об оказании услуг по ведению бухгалтерского учета ), в случае возникновения расхождений между предоставленной другими сторонами исходной информацией и реальными событиями в деятельности предприятия, ответственность за это несут не они.

Получение неполного документа от делового партнера не обязательно влечет за собой применение штрафных санкций к вашей организации.

Отсутствие товарно-транспортной накладной, оформленной по форме 1-Т 
В ходе выездной проверки налоговая инспекция приняла решение о привлечении компании к ответственности. Причиной такого решения, среди прочего, послужило отсутствие товарно-транспортных накладных, оформленных по форме 1-Т. Однако суд не поддержал позицию налоговиков, отметив, что факт оприходования приобретенного товара подтверждается товарными накладными по форме ТОРГ-12. В свою очередь, налоговая инспекция возразила, указав на отсутствие в товарных накладных (ТОРГ-12) ссылки на номер и дату транспортной накладной. Но и этот аргумент был отклонен арбитрами, которые подчеркнули, что «отсутствие ссылки на номер и дату транспортной накладной, при фактическом принятии товара на учет и подтверждении свидетелями факта поставки товара самим поставщиком, не является доказательством ненаступления поставки» (постановление ФАС Западно-Сибирского округа от 22 сентября 2010 г. по делу № А27-391/2010 (определением ВАС РФ от 21.01.2011 № ВАС-67/11 отказано в передаче дела в Президиум ВАС РФ для пересмотра в порядке надзора)). 

В случае выявления нарушений, связанных с первичной документацией, у налогового агента, например, в части НДФЛ, ему грозит штраф по статье 123 Налогового кодекса. Его величина составляет 20% от суммы налога, которую не было удержано и (или) не направлено в бюджет.