Обычно хранение счетов-фактур и других документов, служащих основанием для вычета входящего НДС, составляет 5 лет. Если был произведен перенос вычета, к этому сроку добавляется период, установленный для переноса, но не более трех лет. Однако необходимо учитывать одно важное уточнение.

Счета-фактуры и первичные документы, подтверждающие вычеты входного НДС, обычно срок хранения составляет пять лет. Тем не менее, в отдельных ситуациях необходимость в сохранении этих документов может быть более продолжительной.

Налоговая инспекция начислила НДС, штраф и пени из-за необоснованного заявления о вычетах. При переносе вычетов на более поздний налоговый период, то есть при их переносе, налогоплательщик не предоставил документы, подтверждающие законность применения вычетов.

В течение рассматриваемого периода налогоплательщик не предоставил первичные документы складского учета, которые бы подтверждали поступление на склад и дальнейшую отгрузку оспариваемых товарно-материальных ценностей. Кроме того, он не представил доказательств использования приобретенных товаров, работ и услуг в деятельности, подлежащей обложению НДС.

В соответствии с решением судей, организация обязана была хранить соответствующие документы до окончания установленного срока проведения выездной проверки, относящегося к периоду, в котором был заявлен налоговый вычет (Постановление АС Уральского округа от 6 ноября 2025 г. № Ф09-4156/25 по делу № А60-35980/2024).

В соответствии с пунктом 4 статьи 89 Налогового кодекса Российской Федерации, срок, в течение которого налоговые органы могут провести выездную проверку, составляет три года, отсчитываемых от начала года, в котором принято решение о ее проведении.

Согласно пункту 1.1 статьи 172 НК РФ, вычеты НДС можно переносить на периоды в пределах трех лет после приема на учет соответствующих товаров (работ, услуг), имущественных прав. То есть, если вычет будет заявлен с переносом, то хранить документы придется дольше. Фактически, при продлении срока хранения до максимально допустимого, потребуется хранить эти данные в течение 8 лет.

При вероятности проведения внеплановой проверки добавляется еще один год.